哈尔滨市内的黑龙江省传染病防治院为省级疫情定点医院,哈尔滨医科大学附属第一医院、哈尔滨市医科大学附属第二医院等4所医院为省级后备定点医院,除此之外还有哈尔滨市传染病院、哈尔滨市胸科医院两所市级定点医院和数十所区县级定点医院。